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迈安纳学院 / 知识海洋 / mRNA-LNP疫苗制备流程与免疫评价实验方案分享
   “随着生物技术的飞速发展,mRNA疫苗作为一种新型疫苗技术,凭借其独特的优势在疾病预防和治疗领域展现出巨大的潜力。本文将详细介绍一种针对特定抗原序列的mRNA脂质纳米颗粒(LNP)疫苗的开发流程,以及在小鼠模型中评估其免疫效率的实验方案。该方案涵盖了从mRNA序列设计、合成、LNP封装到小鼠免疫的全过程,并包括了关键的质量控制检测和免疫反应评估技术。”  
     
 

 

 
    
 
1
mRNA序列设计
 
 

mRNA疫苗的核心是其序列设计。本研究中使用的mRNA序列包含5'非翻译区(UTR)、编码5种抗原的序列、GFP报告基因、3'UTR以及聚腺苷酸(PolyA)尾。5'和3'UTR序列对于mRNA的稳定性和翻译效率至关重要,通常来源于高表达基因的UTR区域,如α-珠蛋白基因。PolyA尾不仅促进有效翻译,还能增强mRNA的稳定性,可通过DNA模板编码或在体外转录后添加。此外,质粒中还设计了独特的限制酶位点,便于质粒DNA的线性化,为后续的体外转录(IVT)做准备。

 
    
 
2
质粒DNA准备
 
 

质粒DNA的准备是mRNA合成的基础。通过细菌转化,使用STBL3大肠杆菌细胞放大编码mRNA模板的质粒DNA。这一过程包括将少量质粒DNA与细菌细胞混合、热激处理、培养以及筛选单个菌落进行扩增。最终,使用市售的无内毒素质粒DNA分离试剂(如Promega的PureYield Plasmid Maxiprep System)提取质粒DNA,以确保后续实验的顺利进行。

 
    
 
3
骨髓源性树突状细胞(BMDCs)的生成
 
 

树突状细胞(DCs)是专业的抗原呈递细胞,在启动免疫反应中发挥关键作用。本研究中,通过从6-8周龄小鼠的骨髓中分离细胞,并在GM-CSF的作用下培养分化成BMDCs。这一过程需要精确的细胞操作和培养条件控制,以确保获得高质量的BMDCs,用于后续的体外实验。

 
    
 
4
B16F10黑色素瘤细胞的收集
 
 

B16F10黑色素瘤细胞系用于模拟肿瘤环境,评估疫苗的抗肿瘤效果。细胞在DMEM培养基中培养,至少在解冻后3-7天收集,以确保细胞从解冻过程中恢复,保持良好的生长状态。收集的细胞用于后续的体内移植实验,以评估疫苗的保护效果。

 
    
 
5
mRNA合成与质量控制
 
 

mRNA的合成是疫苗制备的关键步骤。使用线性化的DNA模板进行体外转录(IVT),并在反应中加入CleanCap AG和N1-甲基伪尿苷-5'-三磷酸(m1c),以减少mRNA的免疫原性并提高翻译效率。合成后的mRNA通过Agilent RNA 6000 Nano kit assay进行质量控制,确保mRNA的纯度和完整性。此外,通过dot-blot分析检测IVT RNA样本中的双链RNA(dsRNA)含量,因为dsRNA可能具有免疫原性,影响疫苗的安全性和有效性。

 
   

 

   
 

图 1 .mRNA 纯度和免疫原性的表征

 
     
 
6
I型干扰素(IFN-I)反应检测
 
 

为了评估mRNA的免疫原性,使用THP-1细胞系检测IVT mRNA封装在脂质体中的I型干扰素反应。这一检测不仅有助于评估mRNA本身的免疫原性,还能反映LNP封装对mRNA免疫原性的影响。通过量化细胞上清中的干扰素水平,可以筛选出免疫原性较低的mRNA构建体,为疫苗的安全性提供保障。

 
    
 
7
mRNA-LNP的制备与表征
 
 

mRNA-LNP的制备是疫苗递送系统的关键环节。将mRNA封装在LNP中,以保护mRNA免受降解,并促进其通过内吞/吞噬途径进入细胞。本期文章将继续分享mRNA-LNP的制备流程,包括含、RNA的水相样品准备和微流控法包封mRNA-LNP。

 
     
  7.1 LNP脂质配制  
 

LNP的脂质组分是影响其性能的关键因素之一。常用的LNP配方包括可电离脂质、磷脂DSPC、胆固醇和稳定剂,其摩尔比为50:10:37.5:2.5。这种配方经过优化,能够有效地保护mRNA,促进其在细胞内的释放,并减少免疫原性。

在实际应用中,根据不同的mRNA疫苗或药物的需求,脂质的摩尔比例和总浓度可能会有所调整。例如,BioNTech的BNT-162b2、Moderna的mRNA-1273以及Alnylam的Onpattro等获批用于人体的LNP配方,其脂质组分和摩尔比例各有特点,以适应不同的治疗目标和递送需求。

 
     
 

 

 
    
  7.2 mRNA样品准备  
 

mRNA样品的浓度和氮磷比(N/P)是影响LNP包封效果的重要参数。N/P比是指脂质中的氮原子与mRNA中的磷原子的摩尔比,常用的N/P比为4、6或8。N/P比的计算公式为:

N/P=脂质含N摩尔数/mRNA含P摩尔数

磷(P):每个碱基含有一个磷酸根,1 mol的核糖核苷酸包含1 mol的磷酸基团。RNA脱水聚合后的平均分子量均值为320.5 g/mol。

氮(N):常规的四组分LNP脂质中,以可电离脂质比例计算氮原子数,每个可电离脂质包含1个氮原子(D-LIN-MC3、ALC-0315、SM-102)。以可电离脂质占比50%计算,每mol总脂质中包含0.5 mol的氮原子。注:部分脂质含有多个N原子,或多个组分含有N原子,计算时需注意。

在制备过程中,根据脂质摩尔浓度和N/P比,可以计算出所需的mRNA浓度。例如,当总脂质摩尔浓度为12mM,N/P比为6时,mRNA的浓度约为107 μg/mL。

 
    
  7.3 微流控包封  
 

mRNA-LNP的包封具体步骤如下:

料液准备:按照实验设计,配置水相(包含缓冲液和mRNA)和有机相(脂质混合物)。

注射器装载:将水相和有机相分别吸入注射器中,并排出空气。将装有mRNA溶液的注射器和装有脂质混合物的注射器插入芯片接口。

仪器设置:设置总流速(TFR)为12mL/min、总体积2mL、水相/有机相流速比(FRR)为3:1,初始排废体积为0.35mL,结束排废量为0.05 mL。

运行与收集:启动仪器,收集包封后的mRNA-LNP样品。

后处理:通过超滤或透析将mRNA-LNP换液至特定缓冲液,以去除有机溶剂。

 
    
  7.4 理化数据检测  
 

制备后的mRNA-LNP通过动态光散射(DLS)和Quant-it Ribogreen测定法进行物理化学特性表征,评估其粒径、电位、封装效率和稳定性。这些参数对于确保疫苗的有效递送和释放至关重要

 
     
 

图 2 .新鲜和冷冻 mRNA-LNPs 的理化及稳定性特性的测定

 
    
 
8
抗原呈递的评估
 
 

在B16F10癌细胞系和BMDCs中转染mRNA疫苗后,使用抗H2-Kb/SIINFEKL-PE偶联抗体检测SIINFEKL肽在H2-Kb上的呈递。这一实验步骤不仅验证了mRNA疫苗在细胞内的翻译和抗原呈递能力,还作为质量控制的关键环节,确保疫苗能够有效激活免疫系统。

 
    
 
9
小鼠免疫实验与抗原特异性T细胞反应评估
 
 

在小鼠模型中,通过尾静脉注射mRNA-LNP疫苗进行免疫,评估其诱导的抗原特异性CD8+ T细胞反应。使用四聚体肽-MHC-I复合物(tetramers)检测抗原特异性T细胞,为疫苗的免疫原性提供直接证据。此外,通过肿瘤挑战模型评估疫苗的抗肿瘤效果,以肿瘤生长作为指标,进一步验证疫苗的实际应用潜力。

 
    
  9.1 第 1 - 5 天:给小鼠进行免疫  
 

a. 通过腹腔注射 0.1ml 20% 氯胺酮、10% 戊巴比妥钠混合液(用蒸馏水稀释)使小鼠麻醉(假设小鼠体重为 25 克,麻醉液的注射量应根据体重和麻醉反应进行调整)。

b. 每只小鼠通过眼眶后注射 125μl 1 倍 PBS 稀释的 10μg mRNA-LNP 进行免疫。作为阴性对照,用 1 倍 PBS 对小鼠进行免疫(图 4A)。注意:mRNA-LNP 疫苗可通过其他途径给药,如肌肉注射、皮内注射、皮下注射或鼻内注射。不同的给药途径会对免疫反应的动态和特性产生不同的影响。

c. 在第 5 天给予加强剂量,即 10μg mRNA-LNP 或 1 倍 PBS 作为阴性对照。

 
    
  9.2 第 8 天:分离外周血单个核细胞(PBMC)和脾细胞  
 

a. 在 6 孔板中加入 5ml cold RPMI 培养基,并准备用于脾脏和血液采集的带标签微量离心管。

b. 通过吸入致死剂量的二氧化碳,随后进行颈椎脱臼的方式处死一只小鼠。立即开始解剖。

c. 采血。

d. 脾脏采集。

e. 外周血单个核细胞(PBMC)分离。

f. 脾细胞分离。

g. 第 8 天及以后:使用冷冻的外周血单个核细胞(PBMC)和脾细胞进行多聚体染色分析:注意:在此步骤中,将准备好的 PBMC 和脾细胞用与 mRNA-LNP 疫苗编码的抗原相对应的 MHC-肽多聚体进行染色。最后,每种待分析的组织类型都需要制备对照。

h. 使用新鲜的外周血单个核细胞(PBMC)和脾细胞进行四聚体染色分析。

i. 去除上清液,每孔用 50μl 四聚体染色缓冲液(含 2%胎牛血清的 PBS)和 50nM 达沙替尼重悬。在 25℃ 下孵育 30 分钟。

j. 将四聚体储备液在四聚体染色缓冲液中 1:10 稀释,每孔准备 5μl 稀释后的四聚体溶液。

k. 每孔加入 5μl 四聚体溶液(含 0.5μl 四聚体),重悬所有孔以混合。

l. 在冰上避光孵育 30 分钟。

m. 向每个孔中加入 150μl 四聚体染色缓冲液,然后离心(500×g,5 分钟,4℃)。

n. 撒掉上清液,用 200μl 四聚体染色缓冲液重悬,再次离心(500×g,5 分钟,4℃)。

o. 撒掉上清液,用 100μl 表面染色混合液重悬每个孔。

p. 在冰上避光孵育 25 分钟。每孔准备 100μl 表面染色混合液,含1:1000 的死活染料、1:800 的抗 CD8 AF647 以及 1:400 的抗 CD45 PerCP-Cy5.5、抗 CD3 BV421 和抗 CD4 BV711,均在四聚体染色缓冲液中。

q. 向每个孔中加入 100μl 四聚体染色缓冲液,离心(500×g,5 分钟,4℃)。

r. 撒去上清液。

s. 用 200μl 四聚体染色缓冲液重悬每个孔,再次离心(500×g,5 分钟,4℃)。

t. 撒去上清液,用 200μl 四聚体染色缓冲液重悬。

u. 将样本置于 4℃ 避光保存,直至准备通过流式细胞术进行分析(图 4A - 4E)。注意:最佳荧光素的选择取决于所使用的流式细胞仪。

 
     
 

图 4. mRNA-LNP 疫苗接种后抗原特异性 T 细胞的诱导及抗肿瘤免疫反应

 
 

 

 
 
  结论
 
    
 

本研究详细介绍了mRNA脂质纳米颗粒疫苗的开发流程和小鼠免疫效率分析的实验方案。从mRNA序列设计到LNP封装,再到小鼠免疫实验,每一步都经过精心设计和严格的质量控制。通过这一方案,我们能够开发出具有高效免疫原性和良好安全性的mRNA疫苗,为预防和治疗疾病提供新的策略。尽管实验过程中存在一些局限性,如仅测量IFN-I反应来评估mRNA免疫原性,以及依赖特定抗体来测量抗原呈递,但通过不断优化和改进,mRNA疫苗技术有望在未来的医学领域发挥更大的作用。

 
     
  参考文献:[1] Karekar N, Reid Cahn A, Morla-Folch J, Saffon A, Ward RW, Ananthanarayanan A, Teunissen AJP, Bhardwaj N, Vabre. Protocol for the development of mRNA lipid nanoparticle vaccines and analysis of immunization efficiency in mice. STAR Protoc. 2024 Jun 21;5(2):103087. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103087.  

 

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